另外，未来科学大奖的评审体系主要参考诺贝尔奖、图灵奖等国际著名奖项，采取提名邀约制和国际同行评议制。候选人由科学委员会邀请的提名人提名产生，不接受个人申请与机构推荐。在确定候选人后，由科学委员会确定五位以上该领域的国际专家，对各候选人被提名的工作成果在工作成就、创新性、影响力等方面进行横向和竖向比较。最终的获奖者名单由未来科学大奖科学委员会参考国际同行评议不记名投票确定。同时邀请对外经贸大学法学院高西庆教授和毕马威组成监督委员会，监督整个评奖过程。

　　未来科学大奖科学委员会目前由21位国际知名科学家组成，生命科学奖委员包括杜克大学董欣年、芝加哥大学何川、赛诺菲集团刘勇军、斯坦福大学骆利群、首都医科大学饶毅、北京生命科学研究所王晓东、哈佛大学庄小威;物质科学奖委员包括斯坦福大学鲍哲南、上海交通大学季向东、清华大学毛淑德、麻省理工学院文小刚、清华大学薛其坤、加州大学伯克利分校杨培东、美国Scripps研究所余金权;数学与计算机科学奖委员包括斯坦福大学李飞飞、普林斯顿大学李凯、香港科技大学励建书、布朗大学舒其望、美国西北大学夏志宏、洛杉矶加州大学张懋中、普林斯顿大学张寿武。

　　未来科学大奖单项奖金为一百万美元(人民币约716万元)， 每项奖金由四位捐赠人共同捐赠：“生命科学奖”捐赠人为丁健、李彦宏、沈南鹏、张磊;“物质科学奖”捐赠人为邓锋、吴亚军、吴鹰、徐小平;“数学与计算机科学奖”捐赠人为丁磊、江南春、马化腾、王强。